MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4411918771 · doi:10.1101/2025.07.01.662558

Subtle variations in a client protein determine bacterial Hsp90 dependence

2025· preprint· en· W4411918771 sur OpenAlexaff
Marie Corteggiani, Amine Ali Chaouche, Miha Bahun, Flora A. Honoré, Deborah Byrne, Sébastien Dementin, Mathieu E. Rebeaud, Olivier Genest

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHeat shock proteins research
Établissements canadiensCanadian Nautical Research Society
Organismes subventionnairesCentre National de la Recherche ScientifiqueAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésHsp90ChemistryEnvironmental scienceComputer scienceBiochemistryHeat shock protein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Chaperones ensure protein homeostasis and are conserved across species. The ATP-dependent chaperone Hsp90 is present from bacteria to eukaryotes, where it stabilizes and activates a wide range of substrate proteins called clients. However, what determines whether a protein depends on Hsp90 remains an open question. Here, we focused on the bacterial chaperone Hsp90 and its obligate client TilS (referred to as TilS So ) in the bacterium Shewanella oneidensis . Although Hsp90 is indispensable in S. oneidensis under heat stress by protecting the essential protein TilS So from degradation by the protease HslUV, Hsp90 is dispensable in Escherichia coli , suggesting that E. coli TilS (TilS Ec ) is Hsp90 independent. We therefore compared the TilS orthologs with respect to in vitro stability, in vivo degradation, and interaction with Hsp90 to identify the determinants of the Hsp90 dependence. We found that in contrast to TilS So , TilS Ec was more stable, was not degraded by protease in the absence of Hsp90, and did not interact with Hsp90, indicating that TilS Ec is not a client of Hsp90. Chimeras between TilS So and TilS Ec as well as directed mutagenesis revealed a region of TilS So that is key for protease degradation and Hsp90 protection. Consistent with these results, the growth of S. oneidensis producing TilS Ec was no longer dependent on Hsp90 under heat stress. Conversely, Hsp90 became essential for the growth of E. coli that produced TilS So instead of TilS Ec . Taken together, these results provide new insights into the mechanism of client protection by Hsp90 and the interplay between chaperones and proteases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetHeat shock proteins research→Travaux en français237 207→