Conformational flexibility of tubulin dimers regulates the transitions of microtubule dynamic instability
Notice bibliographique
Résumé
Microtubules are highly conserved polymers of αβ-tubulin dimers that undergo dynamic instability. While dynamic instability is conserved across eukaryotes, many of its associated conformational changes, like lattice compaction and twist, are not. Tubulin dimers sample multiple conformations in solution and undergo conformational changes during polymerization; the rate and extent of these changes describes their “conformational flexibility.” Here, we investigate the relationship between the conformational flexibility of tubulins and the dynamic phenotypes of the microtubules they produce with a comparative study of Drosophila melanogaster tubulin (Dm-Tb) and Bos taurus brain tubulin (Bt-Tb). While these tubulins share high sequence and structural similarity, their microtubules display divergent dynamic phenotypes in vitro , with altered transition frequencies between phases of growth and shrinkage. Dm-Tb microtubules showed drastically longer lifetimes, lower barriers to nucleation, and a high rescue frequency, while maintaining a similar growth rate to Bt-Tb microtubules. 3D reconstruction of mature Dm-Tb microtubules showed high structural conservation with mammalian microtubules. However, when we performed molecular dynamics simulations of free tubulin dimers, we found Dm-Tb to be more rigid and adopt fewer conformational states than Bt-Tb. Biochemical characterizations experimentally confirmed this finding, leading us to hypothesize that differences in the conformational flexibility of tubulins may tune the frequency of transitions between the dynamic phases of microtubules, thereby altering their stability and overall dynamic phenotypes.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».