Predator-prey transmission of a gammaherpesvirus from Asian badgers (Meles leucurus) to endangered Amur tigers (Panthera tigris altaica)
Notice bibliographique
Résumé
We sought to identify herpesviruses in wild Amur tigers (Panthera tigris altaica) of the Russian Far East in and near the Sikhote-Alin Biosphere Zapovednik protected area. We used multiple herpesvirus consensus PCRs targeting the glycoprotein B and DNA polymerase genes followed by DNA sequencing to test blood samples collected over a 22-year period. We found identical herpesvirus sequences in 3 of 41 tigers by consensus PCR and 8 of 41 tigers (19.5%) using a virus-specific PCR. Persistent infection was demonstrated in a tiger that remained virus DNA-positive in three blood samples over a 2.5-year period. Surprisingly, the viral DNA sequence present in tigers had 98.8% identity to mustelid gammaherpesvirus 1 (MusGHV1) commonly found in European badgers (Meles meles), which do not range to the Russian Far East. We then tested 69 blood samples from 11 other carnivore species collected in this region and found that 81.0% (17/21) of Asian badgers (Meles leucurus), but no other species, had MusGHV1 sequences with 99.8-100% identity to those found in tigers. Interaction between Amur tigers and Asian badgers is supported by previous studies demonstrating that badgers are a common prey species for tigers in this region. Taken together, these results are consistent with the interpretation that a strain of MusGHV1 common in Asian badgers was transmitted via predator-prey interactions to Amur tigers. While gammaherpesviruses are generally thought to exhibit strong host species-specificity, our results present an example of cross-species transmission and one of the first examples, to our knowledge, of gammaherpesvirus predator-prey transmission. In addition, we identified novel gammaherpesviruses in sable (Martes zibellina), Asiatic black bear (Ursus thibetanus), and brown bear (Ursus arctos).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».