Lactobacilli and bacterial vaginosis. Species typing and analysis of content levels in the microbiome
Notice bibliographique
Résumé
Objective. To examine changes in lactobacilli composition in the vaginal microbiocenosis associated with bacterial vaginosis (BV) and to assess the frequency of individual species. Material and methods. The study included 40 patients who presented with pathological discharge from the genital tract and had a confirmed diagnosis of BV based on the Amsel criteria. Quantitative assessment and typing of lactobacilli were performed using real-time PCR. Results. All women with BV were found to have lactobacilli present in quantities ranging from 0.01% to 100% of the total bacterial content. Analysis of the distribution of the lactobacilli index (LI), which indicates the proportion of lactobacilli in the total bacterial content, revealed three peaks corresponding to samples with low, intermediate, and high values. During the typing, all four species of lactobacilli characteristic of the vaginal microbiocenosis were identified: L. iners, L. crispatus, L. jensenii, and L. gasseri/L. johnsonii. No samples were found that lacked at least one of these species; L. crispatus and L. iners were the most frequently detected. Despite a general trend toward decreased LI levels in BV, patients were categorized into three subgroups based on their LI values: high, moderately reduced, and low. Conclusion. The positive correlation observed for L. iners and the negative correlation for L. crispatus with the degree of dysbiosis do not, in our opinion, reflect direct cause-and-effect relationships regarding BV, as these correlations are more closely associated with lactobacilli content than with clinical manifestations of the disease. A significant proportion of BV cases with the preservation of lactobacilli dominance suggests the existence of at least two forms of this syndrome. One of them, despite the presence of clinical symptoms, is not associated with a decrease in the number of lactobacilli in the vaginal microbiome.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».