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Enregistrement W4411966493 · doi:10.1016/j.celrep.2025.115929

Early innate immune response and evolution of a SARS-CoV-2 furin cleavage site inactive variant in bat cells

2025· article· en· W4411966493 sur OpenAlexafffund
Kaushal Baid, Sauhard Shrivastava, Jessica G.Y. Luc, Daniel Richard, Jennifer A. Aguiar, Yoan Machado, Sophie‐Marie Aicher, Kimberley C. Siwak, Emmanuelle V. LeBlanc, Zahed Khatooni, Kumari G. Lokugamage, Michelle N. Vu, Angelica L. Morgan, Arkadeb Bhuinya, Kim R Chiok, Hải Thanh Nguyễn, Hannah D. Stacey, Erin Scruten, Tracy Prysliak, Winfield Yim, Andrew G. McArthur, Matthew S. Miller, Heather L. Wilson, Terence D. Capellini, Paul A. Faure, Qiang Liu, Samira Mubareka, Vineet D. Menachery, Karen Mossman, Marcel A. Müller, Christian Drosten, Che C. Colpitts, Nolwenn Jouvenet, Christopher M. Overall, Andrew C. Doxey, Arinjay Banerjee

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensSunnybrook HospitalMcMaster UniversityQueen's UniversityUniversity of British ColumbiaSunnybrook Health Science CentreUniversity of WaterlooUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesGovernment of SaskatchewanCanada Research ChairsNational Institutes of HealthUniversity of TorontoCanada Foundation for InnovationCentre for Research on Pandemic Preparedness and Health EmergenciesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaInstitute of Infection and ImmunityMinistry of Agriculture - SaskatchewanCanadian Institutes of Health ResearchInnovation SaskatchewanGenome Canada
Mots-clésFurinInnate immune systemCleavage (geology)Immune systemBiologyVirologyCell biologyImmunologyBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SARS-CoV-2 has caused the largest known coronavirus pandemic and is believed to have emerged from insectivorous bats. Little is known about the evolution of these viruses in their reservoir bat species. In this study, we investigate the SARS-CoV-2-host interaction using human and bat cells. Bat cells mount a robust and early antiviral response but elicit a dampened proinflammatory response upon SARS-CoV-2 infection compared to human cells. Furthermore, an inactivating R685P mutation within the furin cleavage site (FCS) of the SARS-CoV-2 spike protein is naturally selected for in infected bat cells. Taken together, our data demonstrate that insectivorous Eptesicus fuscus bat cells have evolved a differential antiviral immune response against SARS-CoV-2 infection, likely contributing to their disease tolerance ability. Our study sheds light on the evolution of sarbecoviruses in bats and extends molecular evidence to data from field studies that have demonstrated that SARS-CoV-2-related viruses in wild-caught bats lack an intact FCS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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