Genomic insights into the reticulate evolution of viviparous Phrynocephalus lizards on the Qinghai-Tibetan Plateau
Notice bibliographique
Résumé
The contribution of hybridization to the speciation and diversification of organisms remains a topic of ongoing debate. While ancient reticulate events have been increasingly recognized as a common feature in evolutionary history of many species, the role of hybridization in driving adaptation, especially in extreme environments, is still unclear. The viviparousPhrynocephaluslizards present an excellent system to investigate this question, which are distributed across the Qinghai-Tibetan Plateau (QTP) with most species occurring above 2,300 m above sea level. In this study, we employed an integrative approach combining population genetics, phylogenomics and gene flow assessment to unravel the evolutionary history of this clade using genome-wide dataset. Our results revealed a robust phylogenetic relationship between these species with evidence of multiple reticulate events throughout their colonization to the challenging QTP environments. Notably, we found the two highest-altitude species, P. erythrurus and P. theobaldi, received approximately 41% and 14% of their alleles via interspecific gene flow, respectively. Coding genes in these introgressed regions exhibited significantly accelerated evolution, and were over-represented in functions such as "response to temperature stimulus" and "circulatory system process", including key genes such as ACE and VEGFC, potentially facilitating their adaptation to high-altitude environments. This study suggests the broader relevance of gene flow in shaping evolutionary trajectories of species in extreme environments, and provides novel insights into the understanding of natural hybridization.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».