Improved Growth Media for Isolation and Identification of Fish Pathogenic Tenacibaculum spp.
Notice bibliographique
Résumé
Standard blood agar medium with 2% NaCl (BAS) and Marine Agar (MA) are commonly used in bacteriological investigations of winter ulcers in farmed Atlantic salmon (Salmo salar Linnaeus) in Norway and allow easy recovery of Moritella viscosa based on its characteristic viscous colonies and β-hemolytic activity. However, the recent increase in cases of winter ulcers involving Tenacibaculum spp. and the potential emergence of T. maritimum due to rising temperatures highlight the need for improved methods of isolation and identification. Indeed, the recovery of Tenacibaculum spp. from outbreaks of winter ulcers or tenacibaculosis can be challenging. Despite the development of several agar media over the years to overcome this issue, such as Flexibacter maritimus medium (FMM), it remains difficult to differentiate Tenacibaculum species. We evaluated the growth dynamics and phenotypic characteristics of 13 bacterial isolates commonly associated with ulcer outbreaks on five different agar media, including two new formulations: kanamycin-supplemented marine blood agar for the selective isolation of Tenacibaculum spp. (KABAMA) and general blood agar for marine bacteria (BAMA). These new media facilitate the identification of Tenacibaculum spp., including T. maritimum, by distinguishing colonies based on their specific color, shape, and hemolytic activity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».