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Enregistrement W4411980137 · doi:10.53446/actamednicomedia.1628412

Optimizing Serum RNA Isolation: A Comparative Analysis of Commercial Kits for Yield, Purity, and Contamination Control

2025· article· en· W4411980137 sur OpenAlexaboutno aff
Esra Duman, Özge Özmen

Notice bibliographique

RevueActa Medica Nicomedia · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMolecular Biology Techniques and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIsolation (microbiology)ContaminationContamination controlYield (engineering)ChromatographyChemistryBiologyMicrobiologyMaterials scienceMetallurgy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective: Isolation of RNA from serum samples has gained importance, especially in studies on the use of small RNA molecules such as miRNA as biomarkers. Selection of the optimal kit is critical for the accuracy of downstream processing. The aim of this study was to compare the performance of different commercial kits in terms of efficiency, RNA purity and contamination control during the isolation process. Methods: Three different RNA isolation kits were used for 5 serum samples: 1.miRNeasy Serum/Plasma Kit (Cat. No: 217184, Qiagen, USA), 2.Norgen Plasma/serum RNA purification kit (Cat. No: 55000, Norgen, Canada), 3.Nucleogene RNA isolation kit (Cat. No: NG044, Nucleogene, Turkey). The purity and intensity of the obtained RNAs were evaluated by measuring A260/280 ratios with a nanodrop spectrophotometer. Results: When the concentrations and A260/280 ratios obtained from the kits were evaluated by One Way Anova Test using GraphPad Prism (V10.4.0), it was observed that there was a statistically significant difference between the concentrations and A260/280 ratios of the 3 kits (p≤0.05 and p≤ 0.001). RNAs obtained from Norgene had the lowest concentration and the lowest A260/280 ratio, while Nucleogene had the highest RNA concentration and A260/280 ratio of 2 and above among the three kits (p≤0.05).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,525
Score d'incertitude au seuil0,411

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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