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Enregistrement W4411992534 · doi:10.1016/j.bej.2025.109853

Chalcone isomerase-like (CHIL) impedes the lactone shunt and modulates flux partitioning in isoflavonoid biosynthesis

2025· article· en· W4411992534 sur OpenAlex
Lee Marie Raytek, Meha Sharma, Soon Goo Lee, Mehran Dastmalchi

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBiochemical Engineering Journal · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesUniversity of New BrunswickAgriculture and Agri-Food CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcGill University
Mots-clésIsoflavonoidChalconeChalcone isomeraseBiosynthesisChemistryFlux (metallurgy)BiochemistryChalcone synthaseStereochemistryEnzymeFlavonoidOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT The reconstitution of biosynthetic pathways in heterologous hosts is often challenged by the transition to a foreign cellular environment, lacking compatible structural or regulatory features. Auxiliary or non-catalytic proteins can play a critical role in guiding metabolic flux. Chalcone isomerase-like (CHIL) is a non-catalytic protein known to serve as a partner to chalcone synthase (CHS) in flavonoid biosynthesis, rectifying its promiscuous activity and preventing the formation of by-products, such as p -coumaroyltriacetic acid lactone (CTAL). Here, we extended the functional analysis of CHILs to the legume-characteristic isoflavonoid pathway. We assessed CHIL orthologs, using sequence analysis and structural modelling to predict their respective binding capacities, followed by in vitro characterization. The addition of CHIL to enzyme assays containing CHS, alone or with downstream enzymes, chalcone reductase (CHR) and chalcone isomerase (CHI), reduced CTAL levels (up to 42%) while simultaneously increasing the output of desired intermediates. Combinatorial yeast biotransformation assays described a critical role for CHIL in conducting flux through chalcone, flavanone, and isoflavone biosynthesis. The inclusion of CHIL in engineered yeast strains enhanced overall titers and, unexpectedly, promoted partitioning toward the deoxy-branch (isoliquiritigenin, liquiritigenin, and daidzein) up to 67%, with a 33% increase in final daidzein titers. Therefore, we have revealed an expanded role for CHIL as an auxiliary protein in isoflavonoid biosynthesis and underscored the utility of non-catalytic proteins in metabolic engineering.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,503

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle