HIV Integration into the PTEN Gene and Its Tumor Microenvironment Implications for Lung Cancer
Notice bibliographique
Résumé
Health outcomes for people with HIV (PWH) have improved significantly with combination antiretroviral therapy (ART), yet the risk of lung cancer remains elevated. While a single case cannot establish causality, we describe here an investigation of a 74-year-old male PWH with de novo high-grade neuroendocrine small cell lung carcinoma. To investigate the potential contribution of HIV to cancer development, we performed HIV integration site sequencing on blood, tumor, and non-tumor tissue samples from the patient. We analyzed integration site distribution, clonal expansion, and associated gene disruption. Phosphatase and Tensin Homolog (PTEN) expression was evaluated using immunofluorescence and microscopy. A total of 174 unique HIV integration sites were identified, with 29.9% (52/174) located in clonally expanded cells. The most frequent integration site in clonally expanded cells was within the PTEN gene, representing 4.2% to 16.7% of all HIV-infected cells across samples. PTEN expression was markedly reduced in tumor regions relative to non-tumor tissue. Areas positive for HIV p24 antigen showed minimal PTEN expression. These findings suggest that HIV integration into the PTEN gene, coupled with clonal expansion of HIV-infected cells, may impair anti-tumor immune responses and promote cancer progression in PWH.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».