Sequence Analysis of P4-ATPases Reveals the Structural Determinants for the Stable Monomeric P4B-ATPase Phospholipid Transporters
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT The P4-ATPase family of phospholipid flippases plays a critical role in the maintenance of membrane asymmetry and consequently, various roles in cellular protein traffic and eukaryotic homeostasis. Currently, several structures of these (usually heterodimeric) phospholipid flippases have been resolved, along with extensive biochemical characterization of the substrate transport properties. However, an essential subfamily of monomeric phospholipid flippases, the P4B-ATPases, remains to be characterized in depth. While these P4B-ATPases appear to have similar lipid transport properties to their heterodimeric counterparts, the P4A-ATPases, the basis of their existence as monomers is currently unknown. In addition, the unique features of this group have yet to be comprehensively analyzed since the resolution of one P4B-ATPase member. In this study, we investigated the divergence of P4B-ATPases from other P-type ATPases using a structure-based sequence analysis approach. This led to identification of features unique to P4B-ATPases, as well as previously unidentified conserved properties of P4-ATPases. The results of this study provide a basis for further studies on P4-ATPases to characterize conserved properties of this group that supersedes substrate specificities. MANUSCRIPT INFORMATION - Number of manuscript pages: 20 (double-spaced). - Number of Figures: 5. - Number of Tables: 3. - Supplementary materials include 2 supplementary tables.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».