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Enregistrement W4412053802 · doi:10.1101/2025.06.30.662298

Nuclear Myosin 1 links genomic architecture to adipose tissue remodeling, metabolic inflammation and obesity in mice

2025· preprint· en· W4412053802 sur OpenAlexfundno aff
Samira Khalaji, Tomáš Venit, Zuzana Lukacova, Valentina Fambri, Sachin Kaluarachchi, Maylis Boitet, Maud Fagny, Giuseppe Saldi, Piergiorgio Percipalle

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipose Tissue and Metabolism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesÚstav Molekulární Genetiky, Akademie Věd České RepublikyTamkeenAkademie Věd České RepublikyYork UniversityNew York University Abu Dhabi
Mots-clésAdipose tissueInflammationMyosinTissue remodelingObesityMedicineInternal medicineBiologyCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract During adipogenesis, a metabolic shift from oxidative phosphorylation (OXPHOS) to aerobic glycolysis enables preadipocytes to meet the biosynthetic and energetic demands of differentiation. Nuclear myosin 1 (NM1), a chromatin-associated actomyosin motor that regulates transcription and chromatin accessibility, is essential for maintaining OXPHOS. Here, we identify NM1 as a key regulator of adipocyte differentiation and adipose tissue homeostasis. Integration of ATAC-seq and RNA-seq in NM1-deficient mouse embryonic fibroblasts revealed coordinated dysregulation of adipogenic genes ( Insig1, Lipg, Fat1 ) and altered enhancer accessibility near Klf6, Foxo3, Smad5 , and Gata4 . NM1 knockout mesenchymal stem cells showed impaired adipogenic differentiation despite adipocyte hypertrophy. In vivo, NM1-deficient mice developed age-dependent visceral obesity with transcriptional reprogramming in white adipose tissue (WAT), including downregulation of adipogenesis and mitochondrial pathways, and activation of IFNG-, IL33-, and TNF-driven inflammation. Cross-species analysis revealed overlap with MYO1C -centered regulatory modules in human adipose tissue, implicating NM1/ MYO1C in conserved chromatin-based control of adipose biology

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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