GENETIC CHARACTERIZATION OF A FAMILIAL PATHOGENIC VARIANT OF MAX GENE ASSOCIATED WITH PHEOCHROMOCYTOMA, PARAGANGLIOMA AND DUODENAL/ PANCREATIC NEUROENDOCRINE TUMOURS
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES A 30-year-old male was diagnosed with pheochromocytoma based on hypertension, imaging and biochemistry. He underwent a 14-susceptibility gene panel for PPGLs (Invitae, USA) that revealed a germline pathogenic nonsense heterozygous MYC- associated factor X (MAX) variant (c.223c>t p.arg75*). The patient’s father (61 years old) was found to carry the same germline mutation which led to the diagnosis of a functional abdominal paraganglioma and two neuroendocrine tumors (NETs) in his pancreas and his duodenum that were operated on. Our objective was to determine the causal role of the familial germline MAX pathogenic variant in the development of PPGLs and NETs. METHODOLOGY Leucocyte DNA was extracted from blood cells and tumoral DNA was extracted from FFPE tissues. All 5 exons of the MAX gene (nm_002382.4) were studied by Sanger sequencing. The amplicons were directly sequenced using the applied biosystems 3730xl DNA analyzer (Mcgill University, Genome Quebec, Qc, Canada). RESULTS The germline MAX mutation (c.223c>t p.arg75*) was confirmed in both leucocyte DNA and all tumoral DNA (son: PHEO, father: PGL and NETs). The wild-type max allele was lost in the tumoral DNA of the father’s PGL. A second somatic pathogenic variant of MAX c.263t>c (p.leu88pro) was identified in the duodenal NET and was predicted to be likely deleterious (CADD score 31). CONCLUSION We report the rare association of a familial germline MAX mutation presenting with PPGLs and NETs. A second hit in the MAX gene in the duodenal NET supports the hypothesis that MAX mutations might be associated with multiple endocrine tumors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».