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Enregistrement W4412063727 · doi:10.15605/jafes.037.afes.12

GENETIC CHARACTERIZATION OF A FAMILIAL PATHOGENIC VARIANT OF MAX GENE ASSOCIATED WITH PHEOCHROMOCYTOMA, PARAGANGLIOMA AND DUODENAL/ PANCREATIC NEUROENDOCRINE TUMOURS

2022· article· en· W4412063727 sur OpenAlexaboutno aff
Stéfanie Parisien‐La Salle, Frédéric Mercier, Gilles Corbeil, Nadine Dumas, Franck Vandenbroucke‐Menu, Hugues Widmer, Bich Nguyen, Isabelle Bourdeau

Notice bibliographique

RevueJournal of the ASEAN Federation of Endocrine Societies · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicinePheochromocytomaParagangliomaGeneNeuroendocrine tumorsPancreasPancreatic neuroendocrine tumorInternal medicineEndocrinologyGastroenterologyPathologyGeneticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES A 30-year-old male was diagnosed with pheochromocytoma based on hypertension, imaging and biochemistry. He underwent a 14-susceptibility gene panel for PPGLs (Invitae, USA) that revealed a germline pathogenic nonsense heterozygous MYC- associated factor X (MAX) variant (c.223c>t p.arg75*). The patient’s father (61 years old) was found to carry the same germline mutation which led to the diagnosis of a functional abdominal paraganglioma and two neuroendocrine tumors (NETs) in his pancreas and his duodenum that were operated on. Our objective was to determine the causal role of the familial germline MAX pathogenic variant in the development of PPGLs and NETs. METHODOLOGY Leucocyte DNA was extracted from blood cells and tumoral DNA was extracted from FFPE tissues. All 5 exons of the MAX gene (nm_002382.4) were studied by Sanger sequencing. The amplicons were directly sequenced using the applied biosystems 3730xl DNA analyzer (Mcgill University, Genome Quebec, Qc, Canada). RESULTS The germline MAX mutation (c.223c>t p.arg75*) was confirmed in both leucocyte DNA and all tumoral DNA (son: PHEO, father: PGL and NETs). The wild-type max allele was lost in the tumoral DNA of the father’s PGL. A second somatic pathogenic variant of MAX c.263t>c (p.leu88pro) was identified in the duodenal NET and was predicted to be likely deleterious (CADD score 31). CONCLUSION We report the rare association of a familial germline MAX mutation presenting with PPGLs and NETs. A second hit in the MAX gene in the duodenal NET supports the hypothesis that MAX mutations might be associated with multiple endocrine tumors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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