Genome-wide analysis reveals pathways important for the development and maturation of excitatory synaptic connections to GABAergic neurons
Notice bibliographique
Résumé
Abstract A high degree of cell and circuit-specific regulation has presented challenges for efforts to precisely define molecular mechanisms controlling synapse formation and maturation. Here, we pursue an unbiased forward genetic approach to identify C. elegans genes involved in the formation and maturation of cholinergic synaptic connections with GABAergic motor neurons as indicated by the distribution of GFP-tagged postsynaptic acetylcholine receptors (AChR) on GABAergic dendrites. We identified mutations in 3 genes that identify key processes in synapse/circuit maturation. Mutation of the RUN domain ( R PIP8, U NC-14, and N ESCA) cargo adaptor gene unc-14 dramatically impacts overall GABAergic neuron morphology and dendritic spines. Mutation of the nicotinic acetylcholine alpha subunit gene unc-63 causes a failure in AChR assembly in GABAergic neurons but does not significantly alter dendritic spine structure or abundance. Finally, a mutation in the Liprin-α synaptic scaffold gene syd-2 severely disrupts both dendritic spines and AChR localization. The identification of these three genes from our screen highlights how mechanisms for cargo trafficking, receptor assembly, and synapse structural organization each make distinct contributions to synapse assembly and circuit connectivity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».