Purification and characterization of a novel antibacterial peptide against Clostridium perfringens
Notice bibliographique
Résumé
Bacillus velezensis HG88 was isolated from ileal mucosa samples of egg layer hens that were raised without the use of antibiotics. Its cell-free supernatant (CFS) was found to inhibit the growth of Clostridium perfringens, the causative agent of necrotic enteritis in chickens. The inhibitory compound was determined to be proteinaceous due to its susceptibility to protease digestion. The antimicrobial activity was specific towards C. perfringens, as the CFS did not inhibit the growth of Gram-positive or Gram-negative bacteria across nine different species and two yeast fungi. Separation of proteins from the CFS followed by peptide mass fingerprinting and genomic analyses of the strain enabled the identification of a putative antibacterial peptide with an export signal for secretion from the cell. The peptide from B. velezensis HG88, named IPHG88, has sequence similarity to bacterial SH3 domains that are known to bind to the peptide portion of peptidoglycan. The gene encoding this peptide was cloned, and the peptide was purified from recombinant Escherichia coli as an N-terminal His-tagged peptide. The IPHG88 with or without the His-tag inhibited the growth of C. perfringens with a minimum bactericidal concentration of ~57.0 or 39.1 µg ml−1, respectively. The 3D structure of IPHG88 was also predicted using AlphaFold 2.0.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».