Purification and characterization of a novel antibacterial peptide against Clostridium perfringens
Notice bibliographique
Résumé
Bacillus velezensis HG88 was isolated from ileal mucosa samples of egg layer hens that were raised without the use of antibiotics. Its cell-free supernatant (CFS) was found to inhibit the growth of Clostridium perfringens , the causative agent of necrotic enteritis in chickens. The inhibitory compound was determined to be proteinaceous due to its susceptibility to protease digestion. The antimicrobial activity was specific towards C. perfringens , as the CFS did not inhibit the growth of Gram-positive or Gram-negative bacteria across nine different species and two yeast fungi. Separation of proteins from the CFS followed by peptide mass fingerprinting and genomic analyses of the strain enabled the identification of a putative antibacterial peptide with an export signal for secretion from the cell. The peptide from B. velezensis HG88, named IP HG88 , has sequence similarity to bacterial SH3 domains that are known to bind to the peptide portion of peptidoglycan. The gene encoding this peptide was cloned, and the peptide was purified from recombinant Escherichia coli as an N-terminal His-tagged peptide. The IP HG88 with or without the His-tag inhibited the growth of C. perfringens with a minimum bactericidal concentration of ~57.0 or 39.1 µg ml −1 , respectively. The 3D structure of IP HG88 was also predicted using AlphaFold 2.0.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».