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Enregistrement W4412079950 · doi:10.1111/eva.70125

Epigenetic Responses to Anthropogenic Versus Natural Sources of Oil Exposure Differ in Wild Arctic Seabird Populations

2025· article· en· W4412079950 sur OpenAlexafffundabout
Wing‐Zheng Ho, A.J. Lind, Reyd Dupuis‐Smith, Frédéric Dwyer-Samuel, Samantha Pilgrim, George Gear, Rodd Laing, Gregg T. Tomy, Mark L. Mallory, Jamie Enook, Yasmeen Zahaby, Jennifer F. Provencher, Rowan D. H. Barrett

Notice bibliographique

RevueEvolutionary Applications · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensGovernment of NunavutAcadia UniversityUniversity of ManitobaEnvironment and Climate Change CanadaCarleton UniversityMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlliance de recherche numérique du CanadaCrown-Indigenous Relations and Northern Affairs CanadaEnvironment and Climate Change Canada
Mots-clésBiologyDNA methylationEpigeneticsDifferentially methylated regionsMethylationPopulationSeabirdEcologyGeneticsDNAGenePredationEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Anthropogenic pollution can have detrimental effects on organismal physiology, behavior, and fitness, but the underlying genomic mechanisms mediating these effects are not well understood. Epigenetic regulation, such as DNA methylation, has been proposed as a potential mechanism mediating these effects, but currently, there are few studies in wild populations. Here, we examined the methylation patterns of liver tissues from black guillemot ( Cepphus grylle ) in regions of the Canadian Arctic with different histories of exposure to polycyclic aromatic compounds (PACs)—contaminants associated with hydrocarbons and petrochemicals. As compared to a reference site with minimal PAC exposure, the two sites with exposure to anthropogenic sources of PACs (shipping and spills) shared more differentially methylated regions (DMRs) than they did with the site experiencing chronic exposure to natural PACs (a hydrocarbon seep). Furthermore, we found that guillemots that have been exposed to anthropogenic PACs are characterized by having DMRs with significantly greater ratios of hypermethylated to hypomethylated DNA versus the population experiencing chronic exposure to natural PACs. However, birds from all three sites with elevated PAC exposure shared a core set of DMRs, implying that there are some consistent methylation responses to this family of compounds. Taken together, these results imply that the specific composition and exposure length of PACs can influence the direction of the epigenetic response. The identified DMRs serve as a genomic resource for further research investigating the functional role of DNA methylation in response to anthropogenic oil pollution.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,425
Score d'incertitude au seuil0,596

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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