Hypoosmolarity inhibits archaeal ammonia oxidation
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Salinity strongly influences the physiology and distribution of nitrifying microorganisms, yet the effects of low salinity on them remain understudied. This study investigates the impact of hypoosmolarity on different groups of ammonia oxidizers in soil and lake environments, as well as in pure culture isolates. In soil microcosms amended with ammonium, at low salinity levels (∼120 μS/cm), comparable to values commonly found in pristine terrestrial and aquatic environments, the abundance of ammonia-oxidizing bacteria (AOB), dominated by Nitrosomonas oligotropha , significantly increased. In contrast, the growth of ammonia-oxidizing archaea (AOA), dominated by “ Ca. Nitrosotenuis” of the Nitrosopumilaceae family, was stimulated by high salinity (∼760 μS/cm). In ammonium-fed lake microcosms, the abundance of AOB, dominated by N. oligotropha, significantly increased under both low (∼170 μS/cm) and high salinity (∼850 μS/cm) conditions. In the presence of allylthiourea, a bacterial nitrification inhibitor, AOA were sensitive to low salinity in both soil and lake microcosms. Consistently, pure culture studies revealed marked growth inhibition of AOA, especially members of Nitrosopumilaceae , under hypoosmolarity, unlike AOB and complete ammonia oxidizer (comammox) strains. Comparative genomic analyses with AOB and comammox, along with transcriptomic studies, suggested that the sensitivity of AOA to hypoosmolarity stress was possibly due to a lack of sophisticated osmoregulatory transport systems and their S-layer cell wall structure. Overall, this study highlights hypoosmolarity as a key factor shaping the ecological niches and distribution of ammonia oxidizers, as well as nitrification activities, in terrestrial and aquatic environments that are increasingly affected by intensified water cycles due to climate change.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».