ADME analysis, metabolic prediction, and molecular docking of lipoic acid with SARS-CoV-2 Omicron spike protein
Notice bibliographique
Résumé
Lipoic acid (ALA), also known as 1,2-dithiolane-3-pentanoic acid, is a natural antioxidant and a critical component of mitochondrial function, where it participates in several key enzymatic processes. This organosulfur compound is derived from both plant and animal sources and was initially studied as a potential substitute for acetate. This study aims to examine the parameters related to ADME, metabolic, and structural binding analyses. Furthermore, a molecular docking analysis was performed to explore how ALA interacts with the Omicron variant of SARS-CoV-2. The study revealed that ALA exhibited high gastrointestinal absorption (GI absorption) and a Log Kp (skin permeation) value of -6.37 cm/s. The compound showed compliance with drug-likeness rules, including Lipinski, Ghose, Veber, Egan, and Muegge criteria, but was flagged with a Brenk alert due to the disulfide bond. It demonstrated acute oral toxicity and eye irritation/corrosion, with chemical reactivity involving epoxidation of the oxygen double bond, quinonation, and N-dealkylation processes. In contrast, there was a strong conjugation reaction with UDP-glucuronosyltransferase (UGT) and moderate reactivity with glutathione (GSH), sulfur, and adjacent carbons. Protein interactions displayed medium reactivity, while DNA reactivity was moderate. Additionally, the compound showed limited reactions in unstable oxidation processes and other pathways but exhibited affinity for various enzymes and receptors, including cyclooxygenase-2 and acetylcholinesterase. Molecular docking revealed a predominance of conventional hydrogen bonding with an affinity of -4.4 kcal/mol. These findings suggest a promising pharmacological profile, warranting further investigation into its clinical effects and applications.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».