The ribosomal RNA transcription landscapes of <i>Plasmodium falciparum</i> and related apicomplexan parasites
Notice bibliographique
Résumé
Ribosome biogenesis is essential for the rapid proliferation and life cycle transitions of Plasmodium falciparum, the causative agent of malaria. In eukaryotes, ribosomal RNA synthesis is carried out by RNA polymerase I (Pol I), highly specialized transcriptional machinery. This review provides a comparative analysis of Pol I transcription apparatus in yeast and humans, serving as a reference framework to examine its evolutionary divergence in P. falciparum and related apicomplexans and alveolates. Bioinformatic analyses revealed that some of these organisms lack any identifiable homologues or orthologs of several canonical eukaryotic transcription factors essential for Pol I-mediated transcription, including initiation factor RRN3, activator UBF, and all specific subunits of the promoter recognition complexes. Interestingly, the parasite retains core Pol I subunits, incorporating unique parasite-specific structural domains characterized through AI-based protein complex modeling of P. falciparum Pol I. These adaptations may compensate for the absence of traditional regulatory factors, enabling the parasite to employ distinct mechanisms for promoter recognition and transcription initiation. The substantial differences between parasite and host Pol I transcription machinery create potential targets for therapeutic intervention with parasite-specific elements representing potential drug targets. By integrating evolutionary, structural, and functional perspectives, this review advances our understanding of Pol I transcription in alveolates and its implications for the development of novel antimalarial strategies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».