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Enregistrement W4412111026 · doi:10.1128/aem.00183-25

Practical media formulations for rapid growth of <i>Lactobacillus iners</i> and other vaginal bacteria

2025· article· en· W4412111026 sur OpenAlexaff
Daniella Serrador, Jhenielle R. Campbell, Landon J. Getz, Dorothy Cheung, Gelila Shefraw, Rupert Kaul, William Wiley Navarre

Notice bibliographique

RevueApplied and Environmental Microbiology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensToronto General HospitalUniversity Health NetworkUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGardnerella vaginalisLactobacillusMicrobiologyBacterial vaginosisLactobacillus crispatusMicrobiomeLactobacillus gasseriBacteriaBioinformaticsGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT The composition of the vaginal microbiome is closely tied to host health. Bacterial vaginosis (BV), caused by the overgrowth of specific anaerobes (e.g., Gardnerella vaginalis ), is associated with negative health outcomes. A vaginal microbiome dominated by Lactobacillus species is thought to protect against BV. However, the role of Lactobacillus iners is controversial, with evidence suggesting that some strains may not protect against BV while others do. To better characterize L. iners strains, their interactions with vaginal bacteria and human cells need to be investigated in vitro , but this has been impeded by the lack of liquid media that supports rapid L. iners growth. We have developed three liquid media formulations for L. iners growth: Serrador’s Lactobacillus -adapted Iscove’s medium (SLIM), which supports robust L. iners growth; a vaginally adapted version of SLIM (SLIM-V); and a chemically defined version (SLIM-CD). SLIM and SLIM-V improve L. iners growth compared to previously published formulations and also support the growth of other vaginal bacteria, including Lactobacillus crispatus , Lactobacillus jensenii , Lactobacillus gasseri , and Gardnerella vaginalis . SLIM-CD leads to slower growth but may be useful for characterizing L. iners nutrient requirements or metabolite production. Importantly, SLIM and SLIM-V also support the growth of human vaginal epithelial cells, providing a foundation for future co-culture studies. Here, we present the formulations of SLIM, SLIM-V, and SLIM-CD and compare the growth of bacterial strains and human cells in these media. IMPORTANCE Lactobacillus iners is one of the most prevalent members of the vaginal microbiome, but whether it promotes health or leads to bacterial vaginosis is not well understood. We have developed media formulations that lead to improved L. iners growth and support growth of other vaginal bacteria and human vaginal cells. This will allow for investigation of how L. iners interacts with vaginal bacteria and the host, improving our understanding of its role in the vaginal microbiome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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