WERF Endometriosis Phenome and Biobanking Harmonisation Project for Experimental Models in Endometriosis Research (EPHect-EM-Homologous): homologous rodent models
Notice bibliographique
Résumé
In vivo models of endometriosis enable the discovery and preclinical testing of new therapies. Several rodent models of endometriosis exist, but a lack of harmonization impedes reproducibility and comparability of results among investigators. Homologous models are advantageous as they allow the contribution of the immune system/inflammation to be studied. We reviewed published homologous rodent models of endometriosis to develop standard operating procedures ('EPHect-EM-Homologous-SOPs') to guide and facilitate the choice and implementation of these models and harmonize documentation to enhance interpretation and comparability of results. The World Endometriosis Research Foundation (WERF) established an international working group of experts in models of endometriosis and formed a working sub-group to discuss homologous rodent models of endometriosis. A systematic literature review and detailed analysis of protocols was performed. The identified models have advantages and limitations regarding physiological relevance and utility. To harmonize key variables for endometriosis rodent models, the working group focused on species and animal strains, placement of ectopic tissue, uterine tissue volume, method of induction, hormonal status, and uterine tissue 'type'. A decision tree and recommendations on model use were developed for mice and rats to serve as guides for the use of harmonized EPHect-EM-Homologous-SOPs, experimental design, reporting standards, and research of question-dependent key variables. No 'ideal' homologous model of endometriosis was identified. The choice of model for specific research should be guided according to a best-fit strategy. Harmonization of SOPs, documentation, and reporting standards will improve replicability and translational applicability of studies and better highlight where de novo model creation is needed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,095 | 0,096 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,004 |
| Bibliométrie | 0,012 | 0,010 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,004 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,004 | 0,007 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,011 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».