The role of m6A RNA methylation in a love-hate relationship between porcine rotavirus and host cells
Notice bibliographique
Résumé
N6-methyladenosine (m6A), the most abundant mRNA modification, regulates various mRNA metabolism to affect numerous physiological processes, including immune response. Interestingly, many RNA viruses contain internal m6A modifications that contribute to viral replication and innate immune escape process, but its mechanisms remain unclear. Porcine rotavirus (PoRV) is a common cause of diarrhea and gastroenteritis in piglets. Here, we first revealed the m6A methylation profile on the PoRV genome. PoRV infection significantly reduced methyltransferase METTL3 expression and induced nuclear-cytoplasmic translocation of METTL3. The structural protein VP6 of PoRV can co-localize with METTL3 in the cytoplasm and bind to METTL3 protein, suggesting that PoRV hijacked the host METTL3 to achieve m6A methylation. On the contrary, knockdown of Mettl3 or Ythdf2 in IPEC cells inhibited the replication of PoRV. Mechanistically, silencing of Mettl3 or Ythdf2 enhanced the expression of IRF2 and IFI44L via an increase of mRNA stability of Irf2 and Ifi44l. Furthermore, knockdown of Irf2 and Ifi44l promoted viral replication in IPEC cells. In conclusion, PoRV took full advantage of METTL3 to promote replication, in turn, host reduced own m6A methylation to enhance IRF2 and IFI44L to restrain virus infection, suggesting a love-hate relationship between virus and host, and providing novel targets for developing antiviral drugs in the pig industry.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».