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Enregistrement W4412166395 · doi:10.1200/po-25-00130

Prostate-Related Germline Variant Frequencies Detected in a Cohort of Men With Metastatic Prostate Cancer in Northern India

2025· article· en· W4412166395 sur OpenAlexaff
Atul Batra, Jessica Cockburn, Abhenil Mittal, Rui Bernardino, Tiiu Sildva, Marian S. Wettstein, Amlesh Seth, Brusabhanu Nayak, Sameer Bakhshi, Ranjit Kumar Sahoo, Akash Kumar, Rishabh Jain, Seema Kaushal, Mayank Singh, Sunakshi Chowdhary, Krishna Patel, Raymond H. Kim, Mohammad R. Akbari, Neil Fleshner

Notice bibliographique

RevueJCO Precision Oncology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensWomen's College HospitalUniversity Health NetworkHealth Sciences NorthUniversity of TorontoNOSM UniversityPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProstate cancerGermlineMedicineOncologyProstateCohortInternal medicineCancerGynecologyBiologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE Although prostate cancer is generally associated with favorable outcomes, metastatic disease remains incurable. Additionally, a subset of individuals with high-risk or metastatic disease are likely to harbor at least one germline variant in known prostate cancer association genes. Because of differences in cohort selection and sequencing strategies, the prevalence of germline variants in global populations is unclear. METHODS A whole-exome sequencing (WES) approach was used to explore germline variants in a cohort of patients with metastatic prostate cancer from India. In total, 276 individuals treated at the All India Institute of Medical Sciences in New Delhi, India, were prospectively and consecutively recruited. Blood specimens underwent standard WES and bioinformatic analysis to determine the prevalence of pathogenic and likely pathogenic (PV/LPV) prostate cancer variants, which were then assessed for associations with clinical features. RESULTS In total, PV/LPVs were detected in 11% of individuals across eight genes linked to prostate cancer, most frequently in BRCA2 (3.98%). The distribution reflects previously published findings from other global cohorts, although frequencies in the prevalence of specific variants differ slightly. No relationship between variant status and clinical features were detected, although analysis of a larger cohort may show otherwise. CONCLUSION These results indicate that germline screening for prostate cancer following existing guidelines yield similar variant detection frequencies when focusing on individuals with metastatic disease in the Indian context. In summary, some men are more likely to develop an advanced form of metastatic prostate cancer than others because of differences in their genes, known as variants. This study looked at the how many of these variants are in a group of patients from India. We found that the number of variants in this group was similar to those from other parts of the world, including more found in a gene called BRCA2 .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,061
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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