MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4412194912 · doi:10.1111/jipb.13969

Identifying rubber‐related genes through developing a sense/antisense RNA expression mutant library of <i>Taraxacum kok‐saghyz</i> Rodin

2025· article· en· W4412194912 sur OpenAlexfundno aff
Xiuli Fan, Qingwen Chen, Lianlian Hu, Chunyan Hai, Junhui Zhang, Liquan Kou, Guodong Wang, Xiaoguang Song, Hong Yu, Xia Xu, Jiayang Li

Notice bibliographique

RevueJournal of Integrative Plant Biology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant biochemistry and biosynthesis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaInstitute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of SciencesChinese Academy of SciencesInstitute of GeneticsNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésMutantSense (electronics)GeneBiologyRNAGene expressionCell biologyGeneticsChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Taraxacum kok-saghyz Rodin (TKS) is a promising alternative crop source for producing high-quality natural rubber (NR) and has become an ideal model plant for studying NR biosynthesis, regulation mechanisms, and production. So far, only a very limited number of functional genes related to NR biosynthesis have been identified in TKS. To achieve a systematic identification of its novel functional genes, we developed a mutant system denoted sense/antisense RNA expression (SARE) and have generated more than 8,000 transgenic TKS plants. A series of mutants with altered phenotypes, particularly changes in NR contents, were identified. To evaluate the efficiency of this library, we chose one mutant, c112, which exhibits a significant increase in NR content, for in-depth characterization. The c112 mutant arose from the sense insertion of a dormancy-associated gene1 (DRM1)/auxin repressed protein (ARP) gene, which we named high natural rubber content1 (HRC1). In the c112 mutant, the concentrations of NR precursors isopentenyl pyrophosphate and dimethylallyl diphosphate decreased, while geranylgeranyl diphosphate increased, suggesting that HRC1 regulates metabolic flux in NR biosynthesis. In summary, the developed TKS SARE mutant library provides valuable genetic resources for identifying key functional genes to accelerate the domestication of TKS from wild species to economic crops through molecular breeding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,897

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Integrative Plant BiologyMême sujetPlant biochemistry and biosynthesisTravaux en français237 207