Detection of the ST111 Global High-Risk Pseudomonas aeruginosa Clone in a Subway Underpass
Notice bibliographique
Résumé
P. aeruginosa strain NL201 was cultured from an urban water drain in a populated subway underpass as an environmental isolate for the ST111 global high-risk P. aeruginosa clone. In addition to carrying generally present intrinsic P. aeruginosa antibiotic resistance genes, this serotype O4 isolate also carries a set of additional acquired resistance determinants, including aadA2, blaOXA-10, sul1, and an aac(6′)-Ib family gene. The NL201 isolate features the blaPDC-3 allele, which was found to confer significantly higher catalytic efficiency against cefepime and imipenem compared to blaPDC-1, as well as the potent P. aeruginosa virulence factors exoS, exoT, and algD. Serotype O4 isolates of the ST111 global high-risk P. aeruginosa clone have been reported from clinical samples in Canada and the USA, human stool samples in France, and environmental samples (such as cosmetic, hospital drains, and urban water drain) from various European countries. These observations underscore the effective dissemination of the ST111 global high-risk P. aeruginosa clone between different hosts, environments, and habitats, and they warrant targeted investigations from a One Health perspective on the possible routes of its spread and molecular evolution.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».