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Enregistrement W4412198394 · doi:10.1093/ismeco/ycaf116

Expanding the use of circulating microbiome in fish: contrast between the gut and blood microbiome of <i>Sebastes fasciatus</i>

2025· article· en· W4412198394 sur OpenAlex
Fanny Fronton, Arthur Gandin, David Deslauriers, Daniel Joseph Fyfe Small, Dominique Robert, Yves St‐Pierre

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueISME Communications · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensFisheries and Oceans CanadaUniversité du Québec à RimouskiInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesFisheries and Oceans Canada
Mots-clésMicrobiomeBiologyDysbiosisEcologyGut microbiomeZoologyBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The study of microbiomes in fish populations offers vital insights for ecological and fisheries management, particularly in responses to environmental changes. Although traditional studies have concentrated on the gut microbiome, the emerging concept of a circulating blood microbiome suggests it may act as an early indicator of dysbiosis and various health conditions by reflecting transient bacterial DNA presence. In this study, we examined the gut and blood microbiomes of Sebastes fasciatus (Storer, 1854), a species of redfish of significant economic and ecological importance in the Gulf of St. Lawrence, to obtain critical information for health monitoring, pathogen detection, and ecological management in fisheries. Our results revealed that the gut and blood microbiomes of S. fasciatus have distinct bacterial DNA signatures, with significant differences in microbial diversity. Notably, although both microbiomes exhibited similar dominant genera, specific amplicon sequence variants varied significantly. Through a controlled experimental design, we found that the dietary impacts on microbiome composition were statistically significant yet minimal, suggesting that environmental factors play a more substantial role in shaping microbial communities. Finally, we report the presence of potential pathogens and opportunistic bacteria found exclusively in the blood microbiome. Our results highlight the blood microbiome's value as a sensitive health and environmental stress indicator, essential for sustainable fish population management. Integrating microbiome indicators can improve fisheries management and ecosystem sustainability, offering a model applicable to various marine species and environments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,533
Score d'incertitude au seuil0,283

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle