IL28B genetic variation and treatment response in patients with hepatitis C virus genotype 3 infection
Notice bibliographique
Résumé
UNLABELLED: Polymorphisms near the IL28B gene, which code for interferon (IFN)-λ3, predict response to pegylated interferon-α (PEG-IFN) and ribavirin treatment in hepatitis C virus (HCV) genotype 1 infected patients. Follow-up studies of the effect of IL28B gene in HCV non-genotype 1 infected patients have almost always used predominantly HCV genotype 2-infected or mixed genotype 2/3-infected cohorts with results partly conflicting with HCV genotype 1. We performed a retrospective analysis of 281 patients infected with HCV genotype 3 for association of response to therapy with IL28B polymorphisms. We found that the HCV genotype 1 responder genotypes at rs12979860 and rs8099917 did not associate with sustained virological response to PEG-IFN/ribavirin therapy. However, the responder genotypes of both SNPs showed association with rapid viral response measured at 4 weeks (rs12979860, P = 3 × 10(-5) ; rs8099917, P = 3 × 10(-4) ). In multivariate analysis, age (<40 years), baseline viral load (<4 × 10(5) IU/mL) and the responder genotypes of SNPs rs12979860 or rs8099917 remained significant independent predictors of rapid viral response to therapy. Furthermore, we show that IL28B polymorphisms are associated with relapse in patients who achieve rapid viral response to PEG-IFN/ribavirin therapy. The responder genotypes also showed association with markers of stage and activity of liver disease, namely high aspartate aminotransferase platelet ratio index (APRI, rs12979860, P = 0.018; rs8099917, not significant) and high alanine aminotransferase (ALT, rs12979860, P = 0.002; rs8099917, P = 0.001), in addition to a high baseline viral load (rs12979860, P = 1.4 × 10(-5) ; rs8099917, P = 7.3 × 10(-6) ). CONCLUSION: Polymorphisms near the IL28B gene show association with rapid viral response but not sustained viral response to PEG-IFN/ribavirin therapy in HCV genotype 3-infected patients.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».