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Enregistrement W4412360424 · doi:10.1101/2025.07.08.663711

Exploring cardiac phenotypes of Drosophila orthologues of human genes associated to Brugada Syndrome (BrS)

2025· preprint· en· W4412360424 sur OpenAlexaff
Sallouha Krifa, Julien Barc, Nathalie Gaborit, Flavien Charpentier, Laurent Perrin, Nathalie Arquier

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensCanadian Nautical Research Society
Organismes subventionnairesAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésBrugada syndromePhenotypeGeneDrosophila (subgenus)GeneticsBiologyNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SUMMARY Brugada syndrome (BrS) is a rare cardiac arrhythmic disorder with high risk of sudden cardiac death. Recent advances have identified more than 20 risk loci with complex inheritance suggesting a polygenic model for BrS inheritance. These loci are in non-coding regions located in the vicinity of cardiac-expressed genes. This complex genetic architecture and the limited understanding of BrS genetic and molecular mechanisms hinder the development of efficient prevention strategies in the context of this syndrome and are unfavorable to the implementation of therapeutic interventions. In this context, understanding the functional impact of the identified putative risk alleles is a prerequisite. Here, we used the fly model to systematically test whether orthologues of genes located near risk alleles for BrS participate to cardiac function. The fly is the simplest model with a heart muscle and is a powerful genetic model suitable for efficient screening of candidate genes, providing a whole organism-based assessment of cardiac development, structure and function. Using high-speed heart imaging platform on intact flies, we invalided the cardiac expression of the fly orthologues of human genes associated to BrS and characterized whether they are cell autonomously implicated in heart functioning. Our results provide an overview of cardiac phenotypes associated with genes potentially involved in BrS, enabling their prioritization for further investigations in mammalian models.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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