Exploring cardiac phenotypes of Drosophila orthologues of human genes associated to Brugada Syndrome (BrS)
Notice bibliographique
Résumé
SUMMARY Brugada syndrome (BrS) is a rare cardiac arrhythmic disorder with high risk of sudden cardiac death. Recent advances have identified more than 20 risk loci with complex inheritance suggesting a polygenic model for BrS inheritance. These loci are in non-coding regions located in the vicinity of cardiac-expressed genes. This complex genetic architecture and the limited understanding of BrS genetic and molecular mechanisms hinder the development of efficient prevention strategies in the context of this syndrome and are unfavorable to the implementation of therapeutic interventions. In this context, understanding the functional impact of the identified putative risk alleles is a prerequisite. Here, we used the fly model to systematically test whether orthologues of genes located near risk alleles for BrS participate to cardiac function. The fly is the simplest model with a heart muscle and is a powerful genetic model suitable for efficient screening of candidate genes, providing a whole organism-based assessment of cardiac development, structure and function. Using high-speed heart imaging platform on intact flies, we invalided the cardiac expression of the fly orthologues of human genes associated to BrS and characterized whether they are cell autonomously implicated in heart functioning. Our results provide an overview of cardiac phenotypes associated with genes potentially involved in BrS, enabling their prioritization for further investigations in mammalian models.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».