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Enregistrement W4412366219 · doi:10.1093/nar/gkaf653

The Mgv1–Rlm1 axis orchestrates SAGA and SWI/SNF complexes at target promoters

2025· article· en· W4412366219 sur OpenAlexaff
Chaoyun Xu, Yueqi Zhang, Chengqi Zhang, Li Chen, Yanni Yin, Yun Chen, Zunyong Liu, Zhonghua Ma

Notice bibliographique

RevueNucleic Acids Research · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaNatural Science Foundation of Zhejiang ProvinceNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyPromoterCell biologySWI/SNFTranscription factorHistone acetyltransferaseAcetyltransferaseHistoneTranscription (linguistics)GeneticsPhosphorylationAcetylationGeneNucleosomeGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The SWI/sucrose non-fermentable (SWI/SNF)-facilitated removal of nucleosomes and Spt-Ada-Gcn5 acetyltransferase (SAGA) complex-mediated histone acetylation are crucial for the activation of transcription initiation. However, the mechanism by which these two complexes coordinate to regulate gene expression involved in cell wall remodeling during infection process or in response to external stimuli remains largely unknown in plant pathogenic fungi. Here, we demonstrate that the cell wall integrity (CWI) pathway is activated under toxin (deoxynivalenol)-inducing conditions in the phytopathogenic fungus Fusarium graminearum. This treatment results in the phosphorylation and nuclear translocation of the mitogen-activated protein kinase FgMgv1 in the CWI signaling pathway. Once in the nucleus, the activated FgMgv1 phosphorylates the downstream transcription factor FgRlm1, which binds to a 12- or 14-bp cis-element in the promoters of target genes. Notably, FgMgv1 forms a polymer and interacts with FgRlm1 via its kinase domain. Crucially, this polymerization enables FgMgv1 to recruit both the SWI/SNF and SAGA complexes simultaneously through its C-terminal domain at the target promoters. This coordinated action among FgMgv1, FgRlm1, SWI/SNF, and SAGA ultimately facilitates the transcriptional activation of target genes. Collectively, these findings illuminate a regulatory framework in which Mgv1-Rlm1 axis serves as a key regulatory hub, integrating CWI signals with epigenetic modifications to ensure transcriptional responsiveness to external stimuli.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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