A new phylogeny and phylogenetic classification for Solanaceae
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Solanaceae are a globally distributed family of considerable economic importance. Recent phylogenetic work on various clades in the family has resulted in a plethora of names at various taxonomic levels. This results in a confusing set of names applied to clades at different ranks, and to the use of informal names that are often not accepted in online resources. To solve this problem, we present here a phylogenetic classification following the PhyloCode for the Solanaceae. Traditional taxon names previously recognized at the ranks of tribe, genus, and section were maintained when associated with clades. We base our clade definitions on a newly constructed phylogeny of the family using 10 plastid and nuclear markers with a broad sampling of 1474 species, roughly half of the diversity of the family. We complement this marker‐based analysis with a phylogenomic analysis of 110 taxa (including 97 of the 103 genera in the family and the outgroup Ipomoea purpurea ) using the Angiosperms353 probe set. This pair of analyses produced highly concordant phylogenies and provided strong support for the clades included in the classification. In total, we propose and define rank‐free names for 38 major clades, including 16 infrageneric taxa within the mega‐diverse Solanum . This rank‐free system intends to promote name stability as new data become available, avoiding name changes to well‐known groups.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».