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Enregistrement W4412387072 · doi:10.1093/genetics/iyaf125

Excretory gland cell and NSPC genes in <i>C. elegans</i>: investigating their physiological roles

2025· article· en· W4412387072 sur OpenAlexfundno aff
Zuzanna Mackiewicz, Vladyslava Liudkovska, Andrzej Dziembowski

Notice bibliographique

RevueGenetics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCommission Géologique du CanadaNextGenerationEUHORIZON EUROPE Framework ProgrammeNational Institutes of HealthMiędzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w WarszawieEuropean CommissionNarodowe Centrum NaukiCenters for Disease Control and Prevention
Mots-clésCaenorhabditis elegansBiologyExcretory systemTranscriptomeGeneCell biologyPhenotypeModel organismNematodeGeneticsCellGene expressionAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The nematode Caenorhabditis elegans is one of the best-studied model organisms in molecular biology; however, many aspects of its physiology and the functions of many genes remain poorly understood. In this study, we investigated the role of Nematode-Specific Peptide Family, group C (NSPC) proteins, whose mRNAs were recently identified as primary targets of the poly(A) polymerase TENT-5. Surprisingly, we found that NSPCs are exclusively expressed in the excretory gland cell, a cell with still unclear functionality. Using an optogenetic approach, we precisely ablated the excretory gland cell and observed that, apart from a strong downregulation of NSPCs, nematodes exhibited no transcriptomic or physiological changes in its absence. Additionally, we generated and thoroughly studied a strain with a deletion of all 18 nspc genes, which revealed that, despite previous indications, NSPCs do not influence the worm's defense response. Instead, the transcriptomic analysis showed that the absence of NSPCs results in gene expression changes resembling those observed for DAF-16 mutants, suggesting that NSPCs may somehow influence the key C. elegans insulin signaling pathway. Although further studies are required to explain the exact genetic interaction and elucidate its physiological effects, our findings provide new insights into this unexplored part of nematode physiology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,046
Score d'incertitude au seuil0,868

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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