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Enregistrement W4412391234 · doi:10.3390/cancers17142332

Blood-Epigenetic Biomarker Associations with Tumor Immunophenotype in Patients with Urothelial Carcinoma from JAVELIN Bladder 100

2025· article· en· W4412391234 sur OpenAlexaff
Thomas Powles, Srikala S. Sridhar, Joaquim Bellmunt, Cora N. Sternberg, Petros Grivas, Ewan Hunter, Matthew Salter, Ryan Powell, Ann Dring, Jayne Green, Alexandre Akoulitchev, Roy Ronen, Janusz Dutkowski, Robert A. Amezquita, Chao-Hui Huang, Diane R. Fernandez, Robbin Nameki, Keith A. Ching, Jie Pu, Michelle Saul, Shibing Deng, Alessandra di Pietro, Craig B. Davis

Notice bibliographique

RevueCancers · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBladder and Urothelial Cancer Treatments
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesPfizer
Mots-clésJavelinImmune systemMedicineImmunotherapyAvelumabChromatinEpigeneticsImmune checkpointCancer researchBiomarkerImmunologyTranscriptomeOncologyGeneBiologyGene expressionNivolumabGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND/OBJECTIVES: Response to immune checkpoint inhibitors (ICIs) is associated with several biological pathways, including tumor immunogenicity and antitumor immunity. Identifying host factors involved in these pathways may guide personalized ICI treatment. METHODS: We describe the application of chromatin conformation assays to blood from patients with advanced urothelial carcinoma from the phase 3 JAVELIN Bladder 100 trial (NCT02603432). This trial demonstrated a significant survival benefit with avelumab maintenance plus best supportive care (BSC) vs. BSC alone following non-progression with platinum-based chemotherapy as first-line therapy. Blood-based chromatin conformation markers (CCMs) were screened for associations with high/low immune effector gene expression in tumors and for interactions with outcomes and tumor mutation burden. RESULTS: , which encodes a transcription factor that regulates B-cell maturation. CONCLUSIONS: Our findings suggest that polygenic host factors may affect response to ICIs and support further investigation of chromatin conformation assays.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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