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Enregistrement W4412399198 · doi:10.1371/journal.pgen.1011748

Semaphorin 3f and post-embryonic regulation of retinal progenitors

2025· article· en· W4412399198 sur OpenAlexafffund
Amira Kalifa, Carrie L. Hehr, Katelyn L. Shewchuk, Risa Mori-Kreiner, Shaelene Standing, Rami Halabi, Sarah McFarlane

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAxon Guidance and Neuronal Signaling
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institute for Military and Veteran Health ResearchAlberta InnovatesAlberta Children's Hospital Research InstituteHotchkiss Brain Institute, University of Calgary
Mots-clésBiologyProgenitor cellCell biologyZebrafishProgenitorEmbryonic stem cellRetinaGeneticsNeuroscienceStem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Neural progenitors produce specific cell types that form the circuits of the nervous system. Extrinsic signals regulate both progenitor proliferation and the production of specific neuron types. Where progenitors reside within a progenitor niche determines to which of these signals they are exposed, and thus likely has important consequences on the progeny they produce. Little is known, however, of the signals that govern progenitor location within the niche. Here we show that a member of the Class III family of secreted Semaphorins, Semaphorin3fa (Sema3fa), is required for the orderly arrangement of progenitors with a niche present in the periphery of the larval and adult retina of zebrafish, the ciliary marginal zone (CMZ). CMZ progenitors express mRNAs for various Sema3 receptors, including for nrp2a, nrp2b and plxna1. Loss of Sema3fa in a previously characterized CRISPR/Cas9-generated sema3fa mutant allele (sema3faca304) results in a reduced eye size in juvenile fish, implicating Sema3fa in the ongoing production of retinal cells by the CMZ. Larval progenitors show altered cell cycle parameters, and the spatial organization of functionally distinct progenitors is disrupted, as is the generation of retinal cell types in the appropriate proportions and numbers. Our data support a model whereby Sema3fa secreted by CMZ progenitors reduces adhesive interactions to allow for smooth progression of progenitors through the niche, ensuring progenitors receive the correct recipe of extrinsic signals to secure the proper generation of new retinal circuits.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,324

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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