Scanning electron microscopy and extended viability testing as a tool to evaluate the safety of MALDI-TOF extracts for risk group 3 spore-forming bacteria
Notice bibliographique
Résumé
Introduction. Matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight (MALDI-TOF) MS for rapid identification of risk group 3 (RG3) bacteria is impeded by the following two main limitations: (a) equipment and maintenance costs for instruments placed within containment and (b) lack of a validated inactivation protocol to move RG3 material to a lower containment level. A validated inactivation method would improve operations of public health laboratories by allowing safe triage of potential RG3 agents. Albeit a validated, zero-risk inactivation protocol is unlikely, scientific interrogation of methods to identify and mitigate procedural biosafety risks is vital for institutional risk assessment. Gap. To investigate the effect of a standard MALDI-TOF chemical extraction, hypothesized to alter cells, allowing passage through a filter and maintaining ability to replicate, this study paired visualization using a scanning electron microscope (SEM) with extended viability testing. Aim. This work is intended to support risk assessments for the removal of material from a containment laboratory for MALDI-TOF MS. Methodology. A standard set of Bacillus cereus and Bacillus anthracis vegetative and spore preparations was treated with a formic acid:acetonitrile extraction, with or without filtration, and plated on five types of media to monitor growth over 14 days. SEM images were taken of treated and untreated preparations, prior, during and after filtration across two filters. Reference beads provided accurate pore size measurements. Results. SEM demonstrated no difference in treated and untreated cells but did indicate the ineffectiveness of cellulose filters compared to PVDF filters. Growth was observed in preparations that did not include PVDF filtration, whereas all preparations ( n =60) that included PVDF filtration were 100% non-viable. Although non-viability was observed, an important finding was the passage of 0.262 and 0.173 µm microspheres through the 0.1 µm PVDF filter. Growth of unfiltered preparations was detected between 1 and 7 days. Conclusions. This investigation demonstrates the value of interrogating materials used for bacterial inactivation, highlighting significant issues in the application of filters for exclusion purposes. Visual examination via SEM was key to providing evidence towards a low-risk inactivation method. These findings, with an understanding of limitations identified herein, can be used to inform risk assessments for the removal of RG3 bacteria from containment.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,005 | 0,010 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».