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Enregistrement W4412454555 · doi:10.26434/chemrxiv-2025-dhzgs

Going with the Flow: Mechanistic Insights into Slow Mixing Mode Native Mass Spectrometry

2025· preprint· en· W4412454555 sur OpenAlexafffund
Duong T. Bui, Elena N. Kitova, Lara K. Mahal, John S. Klassen

Notice bibliographique

RevueChemRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMass Spectrometry Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Alberta
Mots-clésMixing (physics)Mass spectrometryFlow (mathematics)ChemistryComputer scienceMechanicsChromatographyPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Slow mixing mode native mass spectrometry (SLOMO-nMS), which monitors the mixing of layered solutions within a nanoflow electrospray ionization (nanoESI) emitter, enables robust quantification of biomolecular complexes in vitro, even when absolute concentrations are unknown. The method relies on mass balance principles, assuming that the concentration of one of interacting species remains constant throughout the mixing process. While this condition is typically achieved by using identical starting concentrations in both solutions, deviations may arise due to non-uniform mass transport within the emitter. Here, we report the first quantitative investigation of the factors governing solution mixing and analyte transport in a nanoESI emitter under an applied electric field. Using a dual-emitter setup and a panel of dyes varying in size and charge, we dissected the contributions of diffusion, advection, and electrophoresis. Our results reveal that diffusion is the primary driver of mixing and, with advection, bulk transport. In contrast, electrophoretic displacement of analyte is negligible at typical nanoESI voltages. Notably, the effective flow rate associated with diffusion is comparable to the overall solution flow rates under low-voltage conditions, highlighting the importance of low-flow regimes for maintaining steady-state concentrations. These findings provide mechanistic validation for the mass balance assumptions underlying SLOMO-nMS and have broader implications for other long-duration nMS experiments that rely on stable solution-phase composition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0020,004
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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