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Enregistrement W4412465522 · doi:10.1021/acscatal.5c03947

G2 Helix as the Plastic Region Modulating Diastereoselectivity of Cyclization in Fungal Bifunctional Sesterterpene Synthases

2025· article· en· W4412465522 sur OpenAlexaff
Weiyan Zhang, Kangwei Xu, Keying Lan, Wei Xu, Kangjie Lv, Yurun Zhang, Jingyu Zhang, Shaoping Nie, Jiang Yi, Tom Hsiang, Lixin Zhang, Ruibo Wu, Xueting Liu

Notice bibliographique

RevueACS Catalysis · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant biochemistry and biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaHigher Education Discipline Innovation ProjectShanghai City Youth Science and Technology Star ProjectScience and Technology Commission of Shanghai MunicipalityNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBifunctionalStereochemistryHelix (gastropod)CatalysisChemistryBiologyBiochemistryEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sesterterpenoids are a rare class of terpenes with potential pharmaceutical applications. To date, most of the currently characterized fungal sesterterpenoids are produced through the catalysis of bifunctional sesterterpene synthases (BF-STPSs). However, the full catalytic potential of BF-STPSs is not yet fully understood. Here, using site-directed mutagenesis and computational simulations, we identified the G2 helix of BF-STPSs as a structurally plastic region that governs divergent cyclization pathways, leading to the formation of unique terpenes with distinct diastereoselectivity. Mutations in the functional site residues of the G2 helix in Type A BF-STPSs, DpPS and FoFS, altered the conformational flexibility of the carbocation intermediates, yielding a series of previously uncharacterized sesterterpenes with unprecedented diastereoselectivity in B-ring cyclization via a selective attack on the diastereotopic faces of the olefin. Notably, FoFS-V195A catalyzed the formation of five different skeleton types, while DpPS-V194A represented a rare example of a protein-engineered switch from a bicyclic to a tricyclic skeleton with a Z -configured Δ 11,12 double bond. Density functional theory (DFT) calculations and molecular dynamics (MD) simulations provided further insights into the reaction details and active site dynamics. These findings highlight key amino acids within the G2 helix of BF-STPSs as mutational hotspots, providing an efficient strategy to accelerate the discovery of structurally diverse sesterterpenes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,397

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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