Population Divergence in the Eastern North American Boreal Forests: Extensive Gene Flow Characterises a Hybrid Zone Between Palm Warbler Subspecies (Parulidae: <i>Setophaga palmarum</i>)
Notice bibliographique
Résumé
Pleistocene glaciations have shaped much of the population divergence events in the coniferous forests of North America. However, unlike in western North America, the evidence for forest fragmentation and population divergence associated with glacial cycles is less clear in the boreal forests of eastern North America. Here, we present the first genomic analysis of an avian hybrid zone in the eastern North American boreal forest between two subspecies of Palm Warblers (Setophaga palmarum). Using both genomic and plumage datasets, we characterise the divergence history of the two subspecies and relate our findings to the larger biogeographic history of the region. We find the Palm Warbler subspecies to have diverged in the mid-Pleistocene (~831 KYA) and have experienced near-continuous gene flow since initial splitting, resulting in a wide hybrid zone and little evidence of reproductive isolation. Coalescent modelling further indicates that the divergence of these two subspecies is congruent with the effects of glacial cycles and suggests a shared biogeographic history with the sole other known example of avian divergence in the region. However, in addition to the general paucity of such events, both of the known divergence events in the eastern boreal forests are characterised by low differentiation at present. This suggests that the conditions in the proposed eastern glacial refugia may not have been sufficient in establishing strong reproductive isolation, which perhaps explains why speciation events have been relatively rare in the eastern boreal forests of North America.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».