Resource-use plasticity governs the causal relationship between traits and community structure in model microbial communities
Notice bibliographique
Résumé
Resolving the relationship between species' traits and their relative abundance is a central challenge in ecology. Current hypotheses assume relative abundances either result from or are independent of traits. However, despite some success, these hypotheses do not integrate the feedback interactions between traits and abundances to predictions of community structure such as relative abundance distributions and trait-abundance relationships. Here, we study how plasticity in resource-use traits governs the causal relationship between traits and relative abundances. We adopt a consumer-resource model that incorporates resource-use plasticity that operates to optimize organism growth, underpinned by investment constraints in physiological machinery for the acquisition of resources. We first show how plasticity in a single species in a community allows all other nonplastic species to coexist, a case of facilitation emerging from competitive interactions. Here, resource-use optimization by the plastic species results in a trade-off between minimizing its similarity with competitors while maximizing its resource-use efficiency in its environment. We apply this trade-off to predict trait-abundance relationships and reveal, unexpectedly, that initial traits are better predictors of equilibrium abundances than equilibrium traits. We then demonstrate that the rate of plasticity controls the coupling strength between trait and abundance dynamics, predicting species' equilibrium relative abundances. This result highlights the importance of transient dynamics in driving species sorting despite the emergence of "ecological equivalence" at equilibrium. Thus, our study explains the unexpected co-occurrence at equilibrium of emergent neutrality and strong trait-abundance relationships. We propose trait-abundance feedback as an ecoevolutionary mechanism linking community structure and assembly, highlighting trait plasticity's role in driving community dynamics.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».