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Enregistrement W4412512330 · doi:10.1038/s41598-025-10175-y

Pseudomonas aeruginosa carriage and associated risk factors in healthy individuals and patients from Rotterdam, Rome, and Jakarta

2025· article· en· W4412512330 sur OpenAlexafffund
Anneloes van Veen, Selvi N. Shahab, Amber Rijfkogel, Martine De Vos, Yulia Rosa Saharman, Anis Karuniawati, Silvia Zelli, Desy De Lorenzis, Giulia Menchinelli, Giulia De Angelis, Maurizio Sanguinetti, Anne F. Voor in ’t holt, Juliëtte A. Severin, Corné H. W. Klaassen, Anniek E. E. de Jong, Merel Kemper, Heike Schmitt, Sima Mohammadi, Valentine Renaud, Irena Kukavica‐Ibrulj, Marianne Potvin, Guillaume Nguyen, Jeff Gauthier, Roger C. Lévesque

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesFakultas Kedokteran, Universitas IndonesiaErasmus Universitair Medisch Centrum RotterdamUniversitas IndonesiaZonMwInternational Development Research CentreJoint Programming Initiative on Antimicrobial Resistance
Mots-clésCarriagePseudomonas aeruginosaRotterdam StudyEnvironmental healthMedicineGerontologyDemographyBiologyBacteriaGeneticsPathologySociology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pseudomonas aeruginosa may colonize humans, however, epidemiological data are scarce. Here, we determined overall and body site-specific carriage rates and associated risk factors among healthy individuals and newly admitted patients in three major cities. This cross-sectional study was conducted in Rotterdam (The Netherlands), Rome (Italy), and Jakarta (Indonesia) between 2022-2024. Adult healthy individuals and newly admitted patients were asked to provide throat, navel, and rectal/perianal swabs, and to complete a questionnaire. Univariable and multivariable analyses were performed to determine factors associated with P. aeruginosa carriage. Carriage rates differed significantly between cities (p < 0.001), and were lowest in Rome (healthy individuals 4.8%; patients 6.5%), followed by Rotterdam (healthy individuals 12.0%; patients 12.7%), and Jakarta (healthy individuals 28.6%; patients 24.0%). In carriers from Rotterdam, P. aeruginosa was most often detected in perianal swabs, while mostly in throat swabs among carriers from Rome and Jakarta. P. aeruginosa carriage had a seasonal association in patients from Rotterdam (p = 0.014) and Jakarta (p = 0.020). Among patients from Jakarta, female sex (aOR 1.98, 95% CI 1.02-3.84; p = 0.045) was associated with P. aeruginosa carriage. Overall, P. aeruginosa carriage rates and colonized body sites differ between cities and are likely associated with climate differences. Our findings warrant setting-specific adaptations of screening strategies and surveillance programs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,056

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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