Comprehensive genotype-phenotype analysis in POLR3-related disorders
Notice bibliographique
Résumé
RNA polymerase III (RNA Pol III)-related disorders (POLR3-RDs) are a group of clinical entities characterized by causal variants in genes encoding RNA Pol III subunits, including POLR3A, POLR3B, POLR1C, POLR1D, POLR3D, POLR3E, POLR3F, POLR3GL, POLR3H, and POLR3K. These typically cause developmental phenotypes affecting the central nervous system; the eyes; connective tissues including bones, teeth, and endocrine axes; and the reproductive system. Similar phenotypes can be caused by variants in separate subunit genes (multigenic). In contrast, variants in the same gene can cause different phenotypes (pleiotropy), making genotype-phenotype correlation challenging. POLR3-RDs, though individually rare, have never been analyzed collectively. To bridge this gap, we developed an extensive database encompassing all published and unpublished cases of POLR3-RDs and conducted the first comprehensive genotype-phenotype correlation study across their entire spectrum. This work contributed new cases, representing 13% of all documented cases in the literature, along with 31 novel variants, accounting for 8% of all identified variants. This database was constructed by systematically reviewing the literature and integrating data from patients under the care of our international network of collaborators. The dataset includes genotype curation, bioinformatics, prior publications, and individual patient outcome information. By leveraging these comprehensive data, we were able to establish clear genotype-phenotype correlations for some pathogenic variants, which will help provide optimal clinical care and genetic counseling (including insights into disease phenotypes and progression) and offer valuable guidance for future clinical trial design and patient stratification.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».