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Enregistrement W4412529796 · doi:10.1016/j.jinf.2025.106558

Umrah- and travel-associated meningococcal disease due to multiple serogroup W ST-11 sub-strains pre-Hajj 2024

2025· article· en· W4412529796 sur OpenAlexaff
Jay Lucidarme, Ala‐Eddine Deghmane, Shalabh Sharma, Courtney Meilleur, Lorraine Eriksson, Paula Mölling, Heike Claus, Nina M. van Sorge, Célia Bettencourt, Maria Paula Bajanca-Lavado, Raymond S. W. Tsang, Dominique A. Caugant, Paola Stefanelli, Arianna Neri, Georgina Tzanakaki, Aiswarya Lekshmi, Helen Campbell, S. A. Clark, Emma J. Heymer, Sonia Ribeiro, Laura Willerton, Lloyd Walsh, Xilian Bai, Thiên‐Trí Lâm, Basanta R. Wagle, Vishakh Walia, Rebecca L. Howie, John Neatherlin, Amy Blain, Madhura S. Vachon, Lucy A. McNamara, Shamez Ladhani, Muhamed‐Kheir Taha, Ray Borrow

Notice bibliographique

RevueJournal of Infection · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBacterial Infections and Vaccines
Établissements canadiensPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHajjMeningococcal diseaseMedicineVirologyNeisseria meningitidisGeographyBiologyGeneticsBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: Collectively, the Hajj and Umrah pilgrimages draw >30 million pilgrims to the Kingdom of Saudi Arabia (KSA) each year. Before Hajj 2024 (14 to 19 June), the meningococcal serogroup W ST-11 complex (W:cc11) Hajj-strain sublineage caused multiple international cases of invasive meningococcal disease (IMD) associated with travel to the Middle East and Asia. Here we identify and characterise the strains responsible. METHODS: All Hajj strain sublineage genomes on PubMLST.org underwent core genome MLST comparisons (PubMLST.org). RESULTS: Isolates from 30 cases, across seven countries, formed five phylogenetic clusters within two distinct strains. Travel histories included KSA, other Middle Eastern countries, India, Mauritius, Kenya via Turkey, and no known associated travel. The prevalent strain, representing four clusters, had no African, and limited Middle Eastern, representation. The geo-temporal distribution of available genomes indicated Eastern Europe as a possible source. CONCLUSIONS: The rapid expansion of Umrah/travel-related W:cc11 IMD cases in early 2024 was due to multiple strains/sublineages. Despite the involvement of non-KSA travel-destinations, the coincidence of cases with the busy month of Ramadan, and the abrupt cessation during Hajj (when vaccine compliance is maximal), suggest that Umrah was a key driver and highlight the need to reinforce mandatory vaccination whilst maintaining global vigilance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,621
Score d'incertitude au seuil0,476

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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