Umrah- and travel-associated meningococcal disease due to multiple serogroup W ST-11 sub-strains pre-Hajj 2024
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: Collectively, the Hajj and Umrah pilgrimages draw >30 million pilgrims to the Kingdom of Saudi Arabia (KSA) each year. Before Hajj 2024 (14 to 19 June), the meningococcal serogroup W ST-11 complex (W:cc11) Hajj-strain sublineage caused multiple international cases of invasive meningococcal disease (IMD) associated with travel to the Middle East and Asia. Here we identify and characterise the strains responsible. METHODS: All Hajj strain sublineage genomes on PubMLST.org underwent core genome MLST comparisons (PubMLST.org). RESULTS: Isolates from 30 cases, across seven countries, formed five phylogenetic clusters within two distinct strains. Travel histories included KSA, other Middle Eastern countries, India, Mauritius, Kenya via Turkey, and no known associated travel. The prevalent strain, representing four clusters, had no African, and limited Middle Eastern, representation. The geo-temporal distribution of available genomes indicated Eastern Europe as a possible source. CONCLUSIONS: The rapid expansion of Umrah/travel-related W:cc11 IMD cases in early 2024 was due to multiple strains/sublineages. Despite the involvement of non-KSA travel-destinations, the coincidence of cases with the busy month of Ramadan, and the abrupt cessation during Hajj (when vaccine compliance is maximal), suggest that Umrah was a key driver and highlight the need to reinforce mandatory vaccination whilst maintaining global vigilance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».