Global inhibition of deadenylation stabilizes the transcriptome in mitotic cells
Notice bibliographique
Résumé
Abstract In the presence of cell division errors, mammalian cells can pause in mitosis for tens of hours with little to no transcription, while still requiring continued translation for viability. These unique aspects of mitosis require substantial adaptations to the core gene expression programs. Indeed, during interphase, the homeostatic control of mRNA levels involves a constant balance of transcription and degradation, with a median mRNA half-life of ∼2–4 hours. If such short mRNA half-lives persisted in mitosis, cells would be expected to quickly deplete their transcriptome in the absence of new transcription. Here, we report that the transcriptome is globally stabilized during prolonged mitotic delays. Typical mRNA half-lives are increased >4-fold in mitosis compared to interphase, thereby buffering mRNA levels in the absence of new synthesis. Moreover, the poly(A)-tail-length profile of mRNAs changes in mitosis, strongly suggesting a mitotic repression of deadenylation. We further show that mRNA stabilization in mitosis is dependent on cytoplasmic poly(A)-binding proteins PABPC1&4. Depletion of PABPC1&4 disrupts the maintenance of mitotic arrest, highlighting the critical physiological role of mitotic transcriptome buffering. Highlights The cellular transcriptome is globally stabilized during prolonged mitotic arrest Distinct poly(A)-tail-length profile of mRNAs in mitosis suggests repression of deadenylation mRNA stabilization in mitosis is dependent on PABPC1 and PABPC4 Degradation of mRNAs during mitosis compromises maintenance of mitotic arrest
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».