Clinical and genetic findings of individuals tested using the navigateAPDS genetic testing program
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Inborn errors of immunity (IEIs), including activated phosphoinositide-3-kinase delta syndrome (APDS), are underdiagnosed due to factors including heterogenous clinical manifestations, lack of awareness, and limited genetic testing access. Genetic testing may establish the molecular diagnosis (MolDx) of numerous IEIs, which may result in management changes. OBJECTIVE: To investigate the clinical utility of the navigateAPDS sponsored program established to increase MolDx of APDS through broad genetic testing. METHODS: The eligibility criteria to receive sponsored testing included APDS clinical features. RESULTS: Between March 2021 and September 2024, a total of 7811 patients across the United States and Canada underwent genetic testing. The median age at time of testing was 33 (range, 0-89) years, and the most selected eligibility criterion was severe, recurrent sinopulmonary infections. Of the 630 patients who received a positive MolDx, 377 (60%) had disorder-associated clinical actionability; 73 (12%) had Food and Drug Administration-approved treatments available. The most identified IEIs included genetically defined common variable immune deficiency and APDS. Of the patients with variants in PIK3CD or PIK3R1, 35 received an APDS MolDx and 131 received a variant of uncertain significance (VUS). Patients with APDS had a median age at time of symptom onset of 3 (range, 0-44) years and a median diagnostic delay of 13 (range, 0-50) years. Of the 13 APDS-causing variants identified, 5 were novel for APDS. CONCLUSION: These findings demonstrate that broad genetic testing for IEIs is useful and may contribute to disease management changes and improved health outcomes. Variant identification and VUS resolution are crucial in elucidating the genetic contribution to the clinical spectrum of IEIs and APDS.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,003 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».