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Enregistrement W4412572673 · doi:10.1111/tid.70082

Utility of Cytomegalovirus Quantitative Polymerase Chain Reaction in Tissue Biopsy for the Diagnosis of Cytomegalovirus Gastrointestinal Disease Among Solid Organ Transplant Recipients

2025· article· en· W4412572673 sur OpenAlexaff
Lucila Baldassarre, Koray Demir, Camille Pelletier Vernooy, Guillaume Laporte, Geneviève Huard, Catherine Girardin, Katarzyna Orlicka, Bich Nguyen, Christian Renaud, Charles Poirier, Julie Morisset, Me‐Linh Luong

Notice bibliographique

RevueTransplant Infectious Disease · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineSt Mary's Hospital CentreMcGill UniversityCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineBiopsyCytomegalovirusHistopathologyInterquartile rangePathologyPolymerase chain reactionGastroenterologyInternal medicineHerpesviridaeImmunologyViral diseaseVirusBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Background Gastrointestinal (GI) cytomegalovirus (CMV) infection is an important cause of morbidity after solid organ transplantation (SOT), and diagnosis mainly relies on histopathology of GI tissue biopsies. CMV detection by quantitative polymerase chain reaction (qPCR) on tissue biopsy is not routinely performed, but potentially holds many practical advantages. Methods We compared the performance of CMV qPCR on fresh GI biopsies to histopathologic identification for the detection of CMV GI disease. Results Sixty‐one SOT patients with GI symptoms underwent endoscopic assessment, with tissue biopsies obtained. Eleven patients had proven CMV disease by histopathologic detection. Among them, all had a positive qPCR on tissue biopsy (median of 8.7 × 10 7 IU/mL [interquartile range {IQR} 3.1 × 10 7 , 18.2 × 10 7 ]). Of the 49 patients with negative histopathology, 27 (55%) had CMV qPCR‐positive tissue biopsy specimens (median of 43 604 IU/mL [IQR 2923, 497 570]). Receiver operating characteristic analysis for optimal threshold value for CMV qPCR on tissue biopsy for diagnosis of proven CMV GI disease was 147 906 IU/mL (sensitivity 100%, specificity 80%, area under the curve = 0.975). Conclusion Compared to histopathologic detection, CMV qPCR on GI tissue biopsy is highly sensitive for the diagnosis of CMV GI disease in SOT patients, making it a potentially useful adjunctive diagnostic tool for rapid diagnosis in this population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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