A New Prognostic Score Based on Cell-Mediated Immunity for Cytomegalovirus Infection After Transplantation
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: The interferon gamma (IFN-γ) enzyme-linked immunosorbent spot is a highly sensitive immune assay that enables the assessment of cytomegalovirus (CMV)-specific cell-mediated immunity (CMI) and can identify at-risk transplant patients of CMV infection; however, its clinical implementation remains elusive. Methods: We developed a novel CMV-CMI risk-score based on the standardized T-SPOT.CMV assay against 2 CMV antigens (immediate-early protein 1 [IE-1] and 65 kDa phosphoprotein [pp65]), a biomarker predicting CMV infection, both high viral replication, and disease by performing a pooled analysis of 570 kidney transplants participating in different clinical trials and subsequently validating it in 146 consecutives solid organ transplants (SOT) in an interventional trial. By incorporating clinical variables into the CMV-CMI risk-score, we built an integrative prognostic system quantifying the risk of CMV infection (CMV-PrognosTIC score) using elastic net penalized regression analysis. Results: < 0.0001, respectively), by combining both responses, 3 CMV-CMI risk-scores appeared, accurately discriminating low-risk (LR) from intermediate-risk (IR) and high-risk (HR) patients (98.7% negative predictive value [NPV], 97.2% sensitivity). Its prospective implementation guiding decision-making in an independent SOT cohort confirmed the very high NPV and sensitivity identifying LR patients. By integrating type of preventive therapy, patient age, and donor (D) and recipient (R) CMV-serostatus to the CMV-CMI risk-score, we generated a global risk-prognostic model showing accurate discrimination and calibration in both derivation (AUC: 0.807) and validation cohorts (AUC: 0.719). Conclusion: We developed a robust CMV-PrognosTIC score to quantify the risk of CMV infection in SOT, which may be readily implemented in clinical transplantation to personalize CMV preventive therapies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».