Genomic Patterns of Loss of Distyly and Polyploidization in Primroses
Notice bibliographique
Résumé
Transitions from outcrossing to selfing and from diploidy to polyploidy often co-occur in plants, likely because the ability to produce selfed seed increases the likelihood of newly formed polyploids to become established. An ideal system to study these transitions is Primula, where the shift from diploid, outcrossing progenitors to polyploid, selfing descendants co-occurred repeatedly and the genetic basis of the mating-system shift is known. In Primula, outcrossing is enforced in distylous, typically diploid species characterized by florally heteromorphic, self-incompatible individuals, whereas selfing is enabled in homostylous, typically polyploid species, characterized by florally homomorphic populations of self-compatible plants. Distyly is controlled by the S-locus supergene. Small loss-of-function mutations in the S-locus CYPT gene, which controls style length and female self-incompatibility, are associated with loss of heterostyly in diploid, ancestrally heterostylous Primula species. However, CYPT and the S-locus have never been investigated in interspecific shifts from distylous, diploid species to homostylous, polyploid species. By analyzing the first assembled genome of a homostylous, polyploid species (Primula grandis) in a comparative framework, we discovered two, nearly identical S-locus alleles in the same subgenome, consistent with the hypothesis that the species originated from a cross between a homostylous, diploid pollen donor and a long-styled, diploid pollen recipient. Conformant to theoretical predictions, the macroevolutionary loss of distyly coincided with considerable degeneration of CYPT, including multiple mutations and exon loss, while other S-locus genes remained largely unaffected. This study advances knowledge on the macroevolutionary dynamics of supergenes and genomes in shifts between breeding systems and ploidy levels.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».