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Enregistrement W4412621662 · doi:10.1111/febs.70196

Tks5 interactome reveals endoplasmic‐reticulum‐associated translation machinery in invadosomes

2025· article· en· W4412621662 sur OpenAlexfundno aff
Léa Normand, Benjamin Bonnard, Margaux Sala, Sylvaine Di-Tommaso, Cyril Dourthe, Anne‐Aurélie Raymond, Jean‐William Dupuy, Luc Mercier, Jacky G. Goetz, Violaine Moreau, Elodie Henriet, Frédéric Saltel

Notice bibliographique

RevueFEBS Journal · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitut National Du CancerLigue Contre le CancerAgence Nationale de la RechercheCNIB Foundation
Mots-clésEndoplasmic reticulumInteractomeTranslation (biology)InvadopodiaCell biologyBiologyComputational biologyEukaryotic translationImmunoprecipitationGeneticsCancerCancer cellGeneMessenger RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ability to progress and invade through the extracellular matrix is a characteristic shared by both normal and cancer cells through the formation of structures called invadosomes, which include invadopodia and podosomes. These invadosomes are plastic and dynamic structures that can adopt different organizations-such as rosettes, dots, or linear invadosomes-depending on the cell types and the environment. In this study, we used the specific invadosome marker SH3 and PX domain-containing protein 2A (SH3PXD2A; also known as Tks5) to identify common features in these different organizations. Tks5 immunoprecipitation coupled with mass spectrometry analysis allowed us to identify common proteins in these different models. We identified elements of the translation machinery, in particular the eukaryotic translation initiation factor 4B (EIF4B) protein, but also endoplasmic reticulum (ER) proteins as part of the invadosome structure. Providing new data on invadosome molecular composition through the Tks5 interactome, we identified that ER-associated translation machinery is recruited to invadosomes and involved in their formation, persistence, and function in all types of invadosomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,592
Score d'incertitude au seuil0,484

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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