A survey of opsin localization, glycosylation, and light/chromophore influence on degeneration in 26 <i>rhodopsin</i> -associated retinitis pigmentosa models
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Purpose Mutations in rhodopsin (RHO) cause autosomal dominant retinitis pigmentosa (RP), which has multiple clinical subclasses, including class B1 (“sector”) RP in which the asymmetric retinal degeneration (RD) suggests an environmental influence. The pathogenic mechanisms of most class B1 mutations are uncharacterized. We generated new animal models of RHO -associated RP to examine RHO expression, localization, glycosylation, and the influence of light and chromophore binding on RD. Methods We generated transgenic X. laevis expressing wildtype or mutant human RHO transgenes. Confocal images were used to evaluate RD and trafficking. Immunoassays were used to quantify RD and investigate RHO glycosylation. Results We created X. laevis models of 26 different forms of RHO -associated RP. Most mutations caused RD, with the exception of those at residue R135 and G101. Many variants did not alter RHO localization. Multiple class B1-associated RHO mutants induced light-dependent RD, suggesting light is the environmental influence associated with the class B1 phenotype. However, the degeneration associated with two partially ER-retained class B1 mutants (S22R and D190G) was not mitigated by dark rearing. P23H and S176F constituted a distinct subclass associated with inner segment retention and proteolytic cleavage. Conclusions Many RHO mutations do not substantially alter RHO localization or glycosylation. The exceptions we identified are P23H and S176F, which dramatically mislocalize, and constitute a distinct category of proteolytically-cleaved misfolding variants. L31Q and T58R induce RD by mechanisms similar to glycosylation-deficient variants, despite lack of glycosylation defects. Intermediate phenotypes indicate at least one previously undescribed mechanism for class B1 RP pathogenesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».