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Enregistrement W4412630158 · doi:10.1097/txd.0000000000001793

Establishing and Validating a Biomolecular Signature of Ischemia/Reperfusion Injury in a Porcine Pancreas Allotransplantation Model

2025· article· en· W4412630158 sur OpenAlexaff
Samrat Ray, Sujani Ganesh, Laura Martínez‐Arenas, Catherine Parmentier, Masataka Kawamura, Bhranavi Arulratnam, Christian Hobeika, Emmanuel Nogueira, Francisco Calderón Novoa, Markus Selzner, Trevor Reichman

Notice bibliographique

RevueTransplantation Direct · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOrgan Transplantation Techniques and Outcomes
Établissements canadiensUniversity of TorontoToronto General HospitalUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineAllotransplantationPancreasTransplantationReperfusion injuryIschemiaBioinformaticsInternal medicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background. Despite considerable advancement in surgical and immunological management in pancreas transplantation, graft pancreatitis remains a feared complication after pancreas transplantation. Identification of molecular mechanisms of underlying ischemia/reperfusion injury (IRI) in pancreas transplantation could, therefore, pave the path for targeted therapy to improve surgical outcomes. The aim of the study was to identify and validate the genes differentially expressed in the early period (24 h) of graft reperfusion in pancreas transplantation. Methods. A porcine pancreas allotransplant model (n = 4) was used to identify and validate the genes aberrantly expressed in 60 min postreperfusion tissue samples (phase 1). Trends of expression of selected genes from phase 1 and corresponding protein product levels in serum were validated at defined time points for >24 h in a technically replicated external cohort (n = 3; phase 2). Results. A total of 104 genes were found to be upregulated at 60 min after pancreas graft reperfusion. The most consistently overexpressed genes were IL6, THBS1, and MIR-21 (micro-RNA) mapped to protein kinase and intracellular signaling molecular pathways. Levels of expression of these genes correlated significantly with serum interleukin-6 ( R = 0.60–0.81; P < 0.01) and tumor necrosis factor-alpha levels ( R = 0.34–41; P > 0.05) at corresponding time points. Conclusions. The results provide new insights into biomolecular pathways (THBS1-IL6-MIR-21 crosstalk and hydroxymethylglutarate coenzyme A reductase–linked nuclear factor kappa B activation) linked to pancreatic IRI in porcine transplantation model. Identification and validation of some novel molecular pathway interactions in human pancreas transplantation could pave the path for potential targeted therapy in alleviating graft injury in the early phases of pancreatic IRI.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,751

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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