Protocols for Pei and Oliveira et al. "LRRK2 G2019S mutation incites increased cell-intrinsic neutrophil effector functions and intestinal inflammation in a model of infectious colitis." v1
Notice bibliographique
Résumé
Parkinson’s Disease (PD) is a neurodegenerative disorder often preceded by gastrointestinal dysfunction. Mutations in leucine-rich repeat kinase 2 (LRRK2) are known risk factors for both PD and inflammatory bowel disease, suggesting a link between PD and the gastrointestinal tract. Using single cell RNA-sequencing and spectral flow cytometry, we demonstrated that the LRRK2 G2019S (Gly2019Ser) mutation is associated with an increased neutrophil presence in the colonic lamina propria during Citrobacter rodentium infection. This concurred with a Th17 skewing, upregulated Il17-a, and greater colonic pathology during infection. In vitro experiments showed enhanced kinase-dependent neutrophil chemotaxis and neutrophil extracellular trap (NET) formation in LRRK2 G2019S mice compared to wild-type counterparts. Our results add to the understanding of LRRK2-driven immune cell dysregulation and its contribution to PD, offering insights into potential biomarkers for early diagnosis and intervention in PD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,004 | 0,002 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,006 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,143 | 0,085 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».